新基因水稻oslsd1的克隆及拟南芥和水稻类lsd1基因家族的生物信息学分析

类lsd1(lsd1-like)基因家族是一类特殊的c2c2型锌指蛋白基因，编码植物特有的转录因子.目前已经研究的2个成员拟南芥lsd1(lesionsstimulatingdiseaseresistance1)和lol1(lsd-one-like1)基因均参与植物细胞程序化死亡(programmedcelldeath,pcd)的调控.从水稻cdna文库中克隆到1个类lsd1基因，命名为oslsd1.该基因长988bp，包含一个432bp的开放阅读框，推导的氨基酸序列(143个氨基酸)含有3个内部保守的锌指结构域.dna印迹结果表明oslsd1基因在水稻基因组中为单拷贝，且在根、茎和叶中表达.借助于生物信息学分析技术，从拟南芥和水稻数据库中各识别出5个和7个(包括oslsd1)类lsd1基因.分析了这些类lsd1基因的结构，蛋白质结构域组成.系统进化分析表明，无论基于编码区的核苷酸或氨基酸序列都可以将这些类lsd1基因分为2类.虽然不存在拟南芥或水稻特有的类lsd1蛋白，但有些结构域是水稻所特有的，也有些基因是来源于复制事件.