snf2家族新成员ercc6l的cdna克隆与表达分析(英)

snf2家族蛋白在基因组复制、修复与表达中具有重要作用.报道了snf2家族新成员ercc6l(excisionrepaircross-complementingrodentrepairdeficiency,complementationgroup6-like)的cdna克隆、特性与表达分析.通过表达序列标签（est）搜索和组装，获得了cdna全长4002bp的新基因ercc6l(genbankacc.noay172688)，然后通过rt-pcr在小鼠胚胎心脏成功克隆了该基因.ercc6l在小鼠基因组中由两个外显子和一个内含子组成，定位于x染色体，最大开放阅读框（orf）编码一个含1240个氨基酸的假定蛋白质.该假定蛋白质含有snf2蛋白的8个保守基序（snf2结构域）.通过与snf2家族各亚家族的成员进行多重比对，初步确认ercc6l属于ercc6亚家族成员.将ercc6l编码区克隆到pegfp-c3然后转染hela,3t3和b16细胞，融合蛋白主要定位于胞浆.blast搜索检索出69条小鼠est与ercc6l同源，这些est主要来自胚胎和肿瘤组织.对小鼠不同发育时期的多种组织进行rt-pcr，发现ercc6l在胚胎期强表达，出生产后表达显著下调.这些结果提示ercc6l在胚胎发育和肿瘤发生中可能具有重要作用.