华南流感病毒ns1基因特性研究

为了解h9n2和h5n1亚型流行性感冒病毒株的ns1基因特性，采用rt-pcr方法测定了12株2000～2003年间在华南地区分离的禽流感病毒株的ns1基因核苷酸序列.测序显示6株h9n2亚型流感病毒ns1基因开放阅读框(orf)长654bp，编码217个氨基酸.6株h5n1亚型毒株ns1基因orf长678bp，编码225个氨基酸.核苷酸和氨基酸同源性分析表明，同一亚型分离株之间有很高的同源性，而不同亚型的h9n2和h5n1毒株之间存在较大差异.blast分析表明，h5n1和h9n2亚型流感病毒分离株的ns1基因分别与近两年从香港特区和华南地区的鸭中分离的毒株a/duck/hongkong/646.3/01(h5n1)、a/duck/shantou/2143/01(h9n2)有很高的亲缘关系.该研究结果为进一步进行ns1功能研究奠定了基础.