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ISSN: 2333-9721
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sars冠状病毒实时荧光rt-pcr定量检测

Keywords: 非典型性肺炎,sars病毒,荧光定量rt-pcr

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Abstract:

为建立一种快速、准确、特异的sars病毒rna定量检测方法,根据复合探针荧光定量分析原理,对sars病毒核酸进行实时荧光定量rt-pcr检测.借助计算机辅助,对sars病毒基因靶序列以及检测引物和探针进行了优化筛选;利用体外转录sars病毒rna靶序列,对rt-pcr反应的镁离子浓度参数进行了优化;比较trizol法、磁珠法、qiagen法、煮沸法等4种方法提取rna的检测效果,建立了样本处理方法;通过对构建的体外转录靶序列模型的检测,对本方法的灵敏度、特异性、定量线性关系、精确度等进行了评价,并通过对42例临床标本的检测对本方法的检测效果进行了评估.通过克隆sars病毒核酸靶序列并进行体外转录,获得了长度约1.2kb的体外转录rna靶序列;经优化,荧光rt-pcr反应液中的mg2+浓度以4.0mmol/l为最好;rna提取方法采用磁珠法效果较好;本方法的检测灵敏度最低可达5个拷贝的体外转录rna分子,特异性100%,ct值的cv值小于5%.对临床确诊的42份sars病人血清和漱口水标本的检测结果表明,该方法的检出率为79%,与荧光抗体检测法的符合率为70%.上述结果表明,该方法建立的荧光定量rt-pcr技术能够快速准确、特异、敏感地对sars病毒核酸进行定量分析,为临床sars冠状病毒rna的检测提供了新的,更为有效的检测方法.

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