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生物化学与生物物理进展 2009
核小体定位与rna剪接Keywords: 多样性增量二次判别方法,核小体定位,剪接位点,rna柔性 Abstract: 根据核小体定位序列和缺失序列的碱基分布特征,应用多样性增量二次判别方法(idqd)构建模型对这两类序列进行了区分,受试者操作特性曲线下的面积达到了0.958.应用这一模型研究了核小体在人类基因组剪接位点(gt/ag)邻近序列中的分布方式,发现外显子所对应的dna序列通常倾向参与核小体的形成,并且由它所转录的rna统计上具有较强的刚性,而剪接位点及其邻近的内含子对应的dna序列则避免参与核小体的形成,所转录的rna统计上具有较强的柔性.进一步还发现,dna序列的核小体定位/缺失和rna的刚性/柔性具有统计相关性,为从机制上解释为何前体rna剪接事件与dna序列中的核小体定位信息有关提供了依据.
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