基于petri网的基因调控网络建模与分析

如何有效描述与分析复杂的基因调控网络(grn)是生物学家研究基因表达调控机制的关键步骤．现有大部分方法在建模过程中忽略了生物中广泛存在的协同作用，模型预测结果与实际生物行为之间存在误差．基于混合函数petri网(hfpn)理论提出了一种对基因调控网络进行定量分析的新方法.首先简要介绍grn与hfpn的基础理论，然后为hfpn引入两类新元素：逻辑库所与逻辑变迁，描述基因调控网络的逻辑规则以及转录因子间的协同作用，最后构建海胆endo16基因调控网络的petri网模型，并预测模型在不同位点发生突变时的基因表达水平变化．分析结果与文献实验数据相一致，验证了方法的正确性．