利用aims分析亚洲9个绵羊群体的群体结构

祖先信息标记(ancestryinformativemakers，aims)可用来分析群体的遗传结构．本研究利用illuminaovinesnp50芯片上的snp位点，在云南乌骨绵羊和其他8个亚洲绵羊群体中以rosenberg等定义的informativeness统计量为筛选方法，选取informativeness值最高的前20、50、100、500个snp位点与相应数目的随机snp位点分别用来推断群体的遗传结构．通过主成分分析和用faststrucure推断祖先成分的方法，评价aims在推断亚洲绵羊群体遗传结构中的作用．研究显示，利用筛选到的高信息含量标记aims，可减少群体结构研究中需要的snp位点数目．前50个aims可有效地将绵羊群体分为4个大类，这与利用全基因组snps分析得到的群体结构是一致的，即乌骨绵羊群体blackbone单独为一类、西藏群体changthangi和tibetan归为一类，孟加拉的banglandeshi、banglandeshigarole群体和印度的indiangarole群体归为一个类群，其余三个群体(印度尼西亚sumatran、garut群体和印度的deccani群体)近似归为一类．这4大类群在aims上存在显著的分化，利用这些位点信息可以为研究群体特征和进化关系提供线索．