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ISSN: 2333-9721
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序列搜索算法在多肽质谱解析中的应用

Keywords: 序列搜索法,质谱,多肽,序列专一性碎片离子

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Abstract:

序列搜索算法由三部分组成:搜索过程、搜索得到多肽的各氨基酸残基的评分及两端(n端、c端)搜索得到的多肽的合并过程.通过若干实际多肽质谱的解析,结果表明,该算法对多种序列专一性离子并存的未知多肽质谱的解析,可获得较满意结果.尤其是它的评分方式及标准,比较适合多肽质谱图的实际情况,可最大限度地判断解析结果的准确度,为从事用质谱测定多肽一级结构的分析工作者提供了一比较简便且可靠的手段.也为质谱法快速测定蛋白质或多肽序列及其在生物学中的普及提供了一条方便之路.

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