用一个简单快速的rt-pcr技术筛选白细胞介素-6作用相关基因

为了研究白细胞介素-6(il-6)作用相关基因以及一些可能受il-6调控的基因，利用一个简单快速的以pcr为基础的方案，检测了il-6处理和未处理的sko007细胞中基因表达的差异，克隆并鉴定了差异表达基因的cdna片段.首先用6-mer寡核苷酸引物进行反转录从而最大限度地将mrna编码区序列生成cdna；然后用2或3个较长的随机引物进行pcr扩增，并以不同引物组合重复pcr增扩；扩增产物在2%琼脂糖凝胶上电泳分离，回收差异片段并直接用于克隆、测序及进一步分析.在此研究中，获得了3个表达序列标签(est)，其中一个为新的基因片段，反向rna杂交有力证实了它们与il-6作用的相关性.进一步的生物信息学分析表明，新基因片段strf17在多种组织中表达.