猪ucp2基因5′调控区和外显子1的遗传变异研究

解偶联蛋白家族(uncouplingproteins，ucps)是线粒体内膜的转运蛋白，具有解离氧化磷酸化偶联的功能，对机体能量平衡涉及的体重(肥胖)、静止代谢率和食物转化效率等性状具有显著的影响.首次对猪ucp2基因外显子1及开放阅读框上游部分序列(－80～0)进行了多态性分析，通过pcr-sscp发现猪群内存在3种单倍型，经测序分析发现存在3个snps位点，分别位于g-42a、c-50t和t-51c位点，这3个snps位点均是首次发现的.该研究表明，t-c-g紧密连锁，c-t-a突变也紧密连锁.利用转录因子在线分析软件tfsearch(ver1.3)，对ucp2基因开放阅读框上游部分序列(－80～0)进行潜在转录因子结合位点预测，发现该片段中的碱基t→c(－51)、c→t(－50)和g→a(－42)突变，导致此处比野生型单倍型a(t-c-g碱基连锁)少了一个aml-1a转录因子结合位点.内江猪存在a、b和ab三种单倍型，而其他猪种仅有单倍型a，说明内江猪具有独特的种质特性.