hpcl2基因表达的选择性剪切分析

2-羟基植烷酸辅酶a裂解酶（2-hydroxypanthyl-coalyase,hpcl2）是3-甲基脂肪酸α-氧化途径中的关键酶.采用鸟枪法测序技术，得到了hpcl2基因的基因组序列.结果显示，hpcl2基因组大小为40829bp，共有17个外显子，16个内含子.外显子平均大小为116bp，内含子平均大小为2429bp，属于结构紧凑基因.从dbest数据库中筛选与hpcl2基因的mrna(genbankacc.:aj131753)相互重叠表达序列标签(est)共有213个，分别来自29个不同的组织.将est与基因组序列进行blast分析，共检测17个est具有选择性剪切，其中14例属外显子遗漏（exonskipping），2例外显子增加(exoninclusion)和1例剪切位点改变(splicingsiteshift).外显子遗漏主要发生在5′端的第3到第8个外显子.结果表明，外显子遗漏可能是hpcl2基因选择性剪切的主要形式.