从中国对虾ests中筛选微卫星标记的研究

利用生物信息学方法在含有10446个中国对虾ests的数据库中进行微卫星序列的筛选,共发现微卫星序列229个,占整个ests数据库的2.19%,其中含双碱基重复序列146个和3碱基重复序列58个,分别占在ests数据库中发现微卫星序列总数的63.76%和25.33%,大部分发现的微卫星序列均为perfect形式的重复序列.根据筛选得到的微卫星序列设计并合成引物19对进行多态性检测,在有扩增产物的16对引物中,首次筛选得到8个中国对虾微卫星标记,并对这些微卫星标记进行了等位基因频率、观测杂合度、期望杂合度、pic值等统计学指标的评价.结果表明,在8个微卫星位点上,等位基因的数目从5到15不等,等位基因长度从165～305bp,期望杂合度和多态性信息含量分别为0.59到0.89和0.56到0.88,表明这8个中国对虾微卫星标记完全适合于遗传分析.