异育银鲫toll样受体3的cdna序列分析与蛋白质高级结构预测

摘要：利用rt-pcr、race及克隆等方法获得了异育银鲫（carassiusauratusgibelio）toll样受体3（cagtlr3）基因全长cdna序列。该cdna全长3170bp，5’端非编码区181bp；3’端非编码区283bp；开放阅读框（orf）2706bp，编码901个氨基酸。经序列同源性分析显示，其编码的氨基酸序列与金鱼[carassiusauratus（goldfish）］、斑马鱼（daniorerio）、斑点叉尾鮰（ictaluruspunctatus）、虹鳟（oncorhynchusmykiss）和红鳍东方鲀（takifugurubripes）有较高的相似性，其相似性分别为92%、88%、79%、75%和72%，说明tlr3在长期的进化中具有较高保守性。tlr3全长序列起始21个氨基酸残基为信号肽；50至695个氨基酸残基间包含15个富含亮氨酸的重复序列（lrr）；704至726个氨基酸残基为跨膜区（tm）；754至897个氨基酸残基为与白介素-1受体高度同源的区域（tir）。将异育银鲫tlr3与人和斑马鱼胞内tir结构的氨基酸比对后发现，phe728、leu738、tyr756与arg736在tlr3的信号转导及胞内定位过程中起到关键作用。异育银鲫tlr3胞外配体结合域的三维结构呈u型，与人tlr3的相应结构十分相似，在n端具有1个二硫键，c端有2个。因lrrs上的插入序列和14个糖基化位点，异育银鲫tlr3胞外配体结合域内表面的大量β-折叠结构呈平坦的平面。