race法分离团头鲂生长抑素全长cdna及其序列测定

生长抑素具有抑制脑垂体gh释放的作用,是调控鱼类生长的主要激素之一.本研究采用rt和race(rapidamplificationofcdnaends)法,分离和测定了团头鲂脑中生长抑素pssicdna的全长核苷酸序列,并对该基因进行了结构和系统进化分析.3'race扩增得到700bp左右的片段,5'race分离得到500bp左右的片段,把3'片段与5'片段拼接得到全长cdna.cdna全长735bp[不含poly(a)],5'端非翻译区有100nt,3'端290bp[不包含poly(a)],阅读框(openreadingframe,orf)345bp.该序列与金鱼pssicdna序列同源性为90%,主要差异在5'端非翻译区.团头鲂生长抑素mrna阅读框编码114个氨基酸,包括一些酶切位点,产生26个氨基酸的大分子态生长抑素,进一步加工成与人等结构相似的14个氨基酸的生长抑素;团头鲂生长抑素前体氨基酸序列与金鱼、虹鳟、鲶鱼、(鱼安)(鱼康)、蛙、牛、鼠、鸡、猴、人等的比较发现,它与金鱼的同源性最高达95%,与(鱼安)(鱼康)最低50%,与人68%.这说明生长抑素基因在长期的进化中相当保守,同时,也因为鱼类生活环境多样导致基因变异较大.