表达序列标签数据库搜索克隆斑马鱼qm基因及其数字化差异显示分析

qm基因是一种与肿瘤抑制、细胞生长、分化、发育和凋亡等有关的重要基因,已在人类及许多物种中得到了克隆,但鱼类中尚无报道.我们利用表达序列标签数据库和电子克隆等技术,成功克隆了斑马鱼qm基因,并对该基因的结构进行了系统分析.结果显示,斑马鱼qm基因cdna全长769bp,含648bp开放阅读框架,编码215个氨基酸,5'utr25bp,3'utr122bp,所编码的qm多肽分子量24.6kda,等电点(pi)10.6,含潜在的蛋白酶c磷酸化位点、n-酰基化位点和酰胺化位点.比较斑马鱼qm和人等13个物种qm的同源性,发现其氨基酸序列相似性为66%～92%.数字化差异显示分析结果表明,qm基因在斑马鱼胚胎及成体多种组织中均有广泛表达.研究结果为今后利用生物信息学快速克隆新的鱼类功能基因打下了方法学基础,也为进一步研究鱼类qm基因功能提供了依据.