凡纳滨对虾脂肪酸结合蛋白基因全长cdna的克隆及序列分析

克隆了凡纳滨对虾脂肪酸结合蛋白基因全长cdna并进行了序列分析。该基因由1042bp的碱基组成,开放阅读框长411bp,编码由136个氨基酸组成的蛋白,基因两翼分别存在113bp(5′端)和518bp(3′段)的非翻译区。聚类分析表明,凡纳滨对虾脂肪酸结合蛋白氨基酸序列与斑节对虾脂肪酸结合蛋白紧密聚为一支,之后聚类顺序依次为刀额新对虾、意大利蜜蜂、斑马鱼、大西洋鲑、鸡、猪和人。通过半定量rtpcr对该基因在不同组织的表达分析表明,该基因在抗ihhnv对虾肠、胃、肝胰腺和肌肉组织中表达较高,在心肌中表达较低,在眼柄中不表达。比较该基因在抗ihhnv对虾和ihhnv易感对虾心、肝胰腺、肠、胃、眼柄和肌肉组织表达发现,该基因在两种对虾心、肠、胃和肌肉组织中的表达无明显差异,但在肝胰腺中抗ihhnv对虾的表达量明显高于ihhnv易感对虾的表达量,说明该基因参与抗性对虾抑制ihhnv感染的免疫过程。