东山湾青石斑鱼线粒体dnad-loop区遗传多样性分析

为研究青石斑鱼种群遗传结构以实现资源保护和可持续利用，实验采用pcr技术对东山湾水域53尾青石斑鱼种群的线粒体dna（mtdna）d-loop区全序列进行扩增并测序，序列长度为956～1230bp，变异很大，这可能是由于5’端含有数目不等的重复序列单元（repeatsequenceunit，rsu）或者由于碱基的插入和缺失造成的。按照rsu数目的不同，把53个青石斑鱼样本分为3大类：2rsu类（占11.3%）、3rsu类（占77.4%）、4rsu类（占11.3%）。采用mega（version3.0）和dnasp（version4.0）软件对序列进行分析，结果显示，53条序列的t、c、a和g碱基平均含量分别为33.4%、17.3%、35.4%和13.9%，共发现53种单倍型，包括179个多态位点，单倍型间平均遗传距离为0.0197，单倍型多态性（hd）为1.000，核苷酸多态性（π）值为0.0172。研究表明，东山湾青石斑鱼种群的遗传多样性处于中等水平。