坛紫菜遗传连锁图谱的构建

以野生型坛紫菜纯系(♀)和红色型坛紫菜纯系(♂)作为杂交亲本,结合四分子分析法及单个体细胞克隆的丝状体途径,创建了由157个株系组成的坛紫菜dh作图群体,并用经过筛选的24对srap引物和16对ssr引物对父母本及作图群体各株系进行双标记分析,获得了224个多态性标记,其中157个标记符合孟德尔分离规律。根据标记间的连锁规律,首次构建了坛紫菜的分子遗传连锁图谱,所构建的遗传图谱由包含124个标记(含srap标记104个,ssr标记20个)的5个连锁群组成,总长度为879.2cm,平均标记间隔为7.09cm,各个连锁群长度为134.2~213.6cm,包含标记18~31个。最后采用3种不同方法计算得到坛紫菜的估计基因组长度平均为955.3cm,由此得到坛紫菜遗传连锁图谱的基因组覆盖率为92.0%。