基于线粒体d-loop区与coi基因序列比较分析养殖与野生银鲳群体遗传多样性

运用线粒体dloop区与coi基因片段序列比较分析了养殖与野生银鲳群体的遗传多样性。研究结果显示，线粒体d-loop区片段中，a、t、c与g4种核苷酸的平均含量分别为40.00%、30.55%、16.75%和12.70%，a+t的含量为70.55%，明显高于g+c的含量。coi基因片段中，a、t、c和g的平均含量分别为25.85%、33.90%、21.30%和18.85%，a+t的含量（59.75%）同样高于g+c的含量。基于d-loop序列分析所得出的两群体总的变异位点、单倍型数、单倍型多样性、核苷酸多样性及平均核苷酸差异数分别为19、15、0.895、0.007和2.505。基于coi基因所得出的两群体总的变异位点、单倍型数、单倍型多样性、核苷酸多样性及平均核苷酸差异数分别为33、17、0.713、0.004和2.239。基于线粒体d-loop区与coi基因片段序列的研究结果均显示，养殖银鲳群体的遗传多样性低于野生群体的遗传多样性。养殖群体基于线粒体d-loop区与coi基因片段分析得出的单倍型多样性分别为0.562与0.571，野生群体基于线粒体d-loop区与coi基因片段分析得出的单倍型多样性分别为0.891与0.801。基于d-loop序列的分子方差（amova）分析结果显示，养殖与野生银鲳群体间具有较高的遗传分化，而基于coi基因片段amova分析结果显示，两群体间并无明显的遗传分化。研究表明，线粒体dloop区与coi基因均可作为检测银鲳群体遗传多样性的有效标记，但线粒体d-loop区作为反映银鲳群体间遗传多样的敏感度要高于coi基因。