牙鲆遗传作图及生长性状qtl定位

采用牙鲆日本群体和韩国群体杂交的92个f1个体作为分离群体,利用微卫星标记和joinmap4.0作图软件构建了牙鲆遗传连锁图谱。共有221个ssr标记用于连锁图谱构建,雌性图谱中,共178个微卫星标记定位到22个连锁群上,观测总长度为(goa)599.0cm,覆盖率(coa)达76.27%。雄性图谱中,共194个微卫星标记定位到23个连锁群上,goa为693.4cm,coa为78.82%。对全长、体质量、体高3组数据进行主成分分析处理,得到可解释3个性状的89.6%特征的一组数据,命名为牙鲆生长性状gt。用winqtlcart2.5软件的复合区间作图，在已构建的遗传连锁图谱上对牙鲆生长性状gt进行qtl定位,取lod经验值2.5为qtl存在的阈值;对微卫星标记进行性状—标记之间的回归分析。本研究共定位3个与牙鲆生长性状gt相关的qtls,qgt-f4qgt-m20qgt-f20,可解释表型变异率分别为27.60%,13.74%,10.27%。在性状—标记之间的回归分析中,得到22个与生长性状gt相关(p<0.05)的微卫星标记,单个标记可解释表型变异率介于3.70%~10.42%,其中6个微卫星标记scaffold558_51720、scaffold558_26183、scaffold903_69232、scaffold485_47120、scaffold1262_77386、scaffold809_65154与生长性状gt之间呈极显著相关(p><0.01),可解释表型变异率分别为10.42%、7.31%、10.07%、10.07%、8.39%和11.26%。