|
水产学报 2013
文蛤30个微卫星标记的开发及在斧文蛤和帘文蛤DOI: DOI:10.3724/SP.J.1231.2013.38484, PP. 1147-1154 Keywords: 文蛤,g-ssrs,est-ssrs,多态性,通用性 Abstract: 利用磁珠富集法构建的基因组文库和est文库开发了30个文蛤多态性微卫星标记。8个g-ssr和22个est-ssr多态性位点共获得140个等位基因,平均等位基因数为4.67,多态性信息含量、观测杂合度、期望杂合度分别介于0.172~0.744、0.040~0.720、0.187~0.793之间;g-ssrs的平均等位基因数、平均多态性信息含量、平均观测杂合度和平均期望杂合度都较est-ssrs高;hardy-weinberg平衡检测发现,24个位点偏离了平衡状态;利用blastx对含多态性ssr位点的est进行功能注释,11个位点来自注释基因序列。将30对文蛤多态性ssr引物分别在斧文蛤和帘文蛤中进行了通用性检测,通用率分别为30%和40%。这些微卫星多态性位点的获得,为进一步开展文蛤遗传多样性分析、种质资源评价、分子标记辅助选育等奠定基础,并且可用于文蛤、斧文蛤和帘文蛤的比较作图、基因发掘和qtl定位等研究。
|