三疣梭子蟹型微卫星标记的发掘及多态性分析

为发掘三疣梭子蟹i型微卫星标记，本研究运用生物信息学方法，从ncbi数据库已公开的13985条三疣梭子蟹est序列中搜索微卫星位点。结果显示，共搜索到287个微卫星位点，其中主要为二核苷酸重复序列（173个），占总数的60.3%；其次为三核苷酸重复序列（79个），占总数的27.5%；四、五、六核苷酸重复位点较少；在二核苷酸重复位点中，ac/gt重复位点最为丰富，占二核苷酸重复位点总数的53.8%，ag/ct重复次之，占二核苷酸重复位点总数的37.0%，at和gc重复较少。挑选14个i型微卫星标记在野生三疣梭子蟹群体中进行多态性检测，发现8个位点呈多态性，平均多态信息含量（pic）和平均遗传杂合度（h）分别为0.57和0.63。其中6个多态性位点的pic值大于0.5，呈现较高多态性特征。研究表明，基于三疣梭子蟹est数据发掘ⅰ型微卫星标记的方法切实可行。本研究发掘的ⅰ型微卫星标记将为三疣梭子蟹遗传多样性评估、遗传连锁图谱构建和qtl分析提供有效的分子标记。