创伤弧菌物种特异性检测靶标基因的发掘及评价

实验根据genbank公布的细菌全基因组数据,采用比较基因组学分析创伤弧菌与其它细菌基因组间的差异,筛选出34个潜在的创伤弧菌物种特异性检测靶标基因,其中vv1_2692、vv2_0075和vv2_0939这3个基因已有功能注释。常规pcr扩增结果显示这3个基因均具有良好的特异性和灵敏度。进而以这3个基因和传统靶基因vvha作为检测靶标,采用常规pcr技术检测来自杭州市农贸市场的137份海产品中创伤弧菌,发现vv2_0075、vv2_0939和vvha基因的检测结果与传统生化鉴定方法一致,表明新发掘的vv2_0075和vv2_0939基因在对海产品中创伤弧菌检测时具有很好的稳定性和很强的抗干扰能力。在137份海产品中创伤弧菌的检出率为28.5%,其中牡蛎的检出率最高(68%),表明杭州市农贸市场售卖的海产品,尤其是牡蛎中的创伤弧菌污染现状严重,应加强对杭州市海产品中创伤弧菌污染状况的监测。