缢蛏igfbp基因结构及生长性状相关snp筛选

类胰岛素生长因子结合蛋白(igfbp)是igf系统的一部分,主要参与igf的运输、定位和生物活性调节。本研究采用race技术和长pcr技术,克隆了缢蛏igfbp基因的cdna和dna全长序列,应用荧光定量pcr技术分析了缢蛏不同发育时期和不同组织中igfbpmrna的表达特征,并进一步筛选了igfbp基因与生长性状相关的snp位点。序列分析表明,缢蛏igfbpcdna序列全长631bp,包括5'端非编码区60bp,3'端非编码区136bp和开放阅读框435bp,编码144个氨基酸。该基因含有保守的igfbp-n端,包含12个半胱氨酸残基,其中1～18个氨基酸为信号肽,属于分泌型蛋白。igfbpdna全长3122bp,其中包含1个内含子(2687bp)和2个外显子(200和235bp)。荧光定量pcr结果显示,igfbpmrna在消化腺组织中表达量最高;在缢蛏的稚贝期,igfbpmrna呈现高表达,而在其他发育时期表达量低。在igfbp基因中筛选到4个snp位点,其中1个snp位点与缢蛏的壳长和体质量呈显著相关。