背瘤丽蚌f型线粒体基因组全序列分析

部分双壳贝类的线粒体遗传方式是特殊的双重单亲遗传方式:f型存在于雌性体细胞组织和性腺中,m型仅存在于雄性个体的性腺中。通过la-pcr扩增、shot-gun测序、软件拼接获得背瘤丽蚌(lamprotulaleai)f型线粒体基因组全序列。线粒体基因组全长为16530bp,包括13个蛋白质编码基因,22个trna其中包括2个trnaser和2个trnaleu,2个srrna及27个长度不等的非编码区,最长的两个非编码区分别为969bp、228bp。比较分析已登录到genbank中的淡水蚌类f型线粒体结构特征,结果显示背瘤丽蚌f型a+t含量为60.28%,表现出a+t偏好性,淡水蚌类线粒体基因组长度的差异主要表现为非编码区长度的差异。此外,背瘤丽蚌mtdna的coⅱ-12srrna区域基因排列存在差异,是nd3、trnahis、trnaala、trnaser1、trnaser2、trnaglu、nd2、trnamet8个基因发生重排造成。f型线粒体序列构建的系统进化树中,淡水蚌类和海水双壳贝类分别聚为一支。研究结果为进一步研究淡水珍珠蚌的dui线粒体遗传方式和种质资源保护奠定基础,为双壳贝类mtdna基因重排提供依据。