东北太平洋深海沉积物细菌多样性

采用两种方法提取中国结核合同区东区沉积物不同层次总dna，通过克隆测序构建了含有79个克隆子的细菌16s？rrna基因文库，分析了该海域沉积物中细菌的多样性。79个克隆在系统发育树中形成了11个大分支，包括gamma？proteobacteria(22.8%)，alpha？proteobacteria(16.5%)，planctomycetacia(7.6%)，delta？proteobacteria(6.3%)，？nitrospira(6.3%)，actinobacteria(6.3%)，beta？proteobacteria(5%)，acidobacteria(5.1%)，sphingobacteria(3.8%)，firmicutes(2.5%)，other？bacteria(177%)，其中gamma？proteobacteria在总文库中所占比例最高，该分支细菌在0～2cm、4～6cm层也是优势菌种。gamma？proteobacteria中假单胞菌（pseudomonas）为优势属（22.2%）。各个层次中所含细菌类群有所不同，alpha？proteobacteria、gamma？proteobacteria、delta？proteobacteria？、planctomycetacia、nitrospira？、actinobacteria和acidobacteria为三层样品共有类群。