基于线粒体细胞色素c氧化酶亚基i基因序列的帘蛤科贝类分子系统发育研究

对21种帘蛤科贝类线粒体细胞色素c氧化酶亚基i(cytochromecoxidasesubuniti,coi)基因核苷酸序列进行了分析,以探讨这一序列在种质鉴定、分子系统发生研究中的应用价值.测序结果表明,所有物种扩增片段长度均为707bp(含引物),序列a+t含量(62.4%-67.8%)明显高于g+c含量.物种间共有变异位点379个,其中简约信息位点334个;此区段共编码235个氨基酸,种间共有氨基酸变异位点100个.以coi基因片段序列为标记,用中国蛤蜊(mactrachinensis)作外群,构建了35种帘蛤科贝类(其中14种贝类coi序列从genbank下载)的系统发生树,结合拓扑结构分析和序列比对分析,结果表明:支持将短文蛤(meretrixpetechinalis)和丽文蛤(m.lusoria)订为文蛤(m.meretrix)的同物异名的观点,建议将丽文蛤和短文蛤订为文蛤的地理亚种;支持将薄片镜蛤(dosiniacorrugata)和d.angulosa订为2个独立种的观点;认为将波纹巴非蛤(paphiaundulata)和织锦巴非蛤(p.textile)订为2个独立种是合适的.coi基因序列含有丰富的遗传信息,适合作为帘蛤科贝类种群遗传结构和系统发生研究的分子标记.