新疆沙湾冷泉沉积物的细菌系统发育多样性

为了解新疆沙湾冷泉沉积物的细菌群落组成与类群多样性，利用免培养方法直接从沙湾冷泉沉积物中提取环境总dna，构建细菌16srrna基因文库。对随机挑选的241个细菌阳性克隆子进行haeiii酶切分型得到86个可操作分类单元(otus)，系统发育分析将其归为11个门：放线菌门(actinobacteria)，酸杆菌门(acidobacteria)，拟杆菌门(bacteroidetes)，绿菌门(chlorobi)，蓝细菌门(cyanobacteria)，厚壁菌门(firmicutes)，芽单胞菌门(gemmatimonadetes)，硝化螺旋菌门(nitrospirae)，变形菌门(proteobacteria)，浮霉菌门(planctomycetes)，疣微菌门(verrucomicrobia)。其中酸杆菌门和变型菌门为优势类群，分别占细菌克隆文库的48%和25%。超过1/3的otus序列与genbank中已存序列具有较低相似性(相似性小于95%)。此外20%左右的克隆子与固氮细菌和硝酸盐氧化细菌相关。研究结果表明，新疆沙湾冷泉沉积物中细菌种类丰富，代谢类型多样而且存在大量未知类群。