西施舌5个地理群体its1序列变异及系统发生分析

利用核糖体rrna基因第一内转录间隔区（its1）序列，对我国山东日照（rz）、江苏连云港（lyg）和启东（qd）、福建长乐（cl）、广西北海（bh）沿海西施舌5个野生群体的遗传结构进行了分析。经pcr扩增、克隆、非克隆测序，获得长度为816—843bp的its1核苷酸序列,其平均g+c含量（60.8%）显著高于a+t含量。在西施舌5个群体93个个体118个序列中共检测到153个变异位点，多态位点比例为18.3%，其中，简约信息位点为63个，共有63种基因型。群体间遗传距离在0.74%—338%之间，群体内遗传距离为0.72%—1.06%之间。cl群体与其他4个群体间的遗传距离明显高（3.17%—3.38%）。amova分析结果显示长乐群体有明显的遗传分化（fst=0.670—0.702，p﹤0.001）。以中国蛤蜊为外群构建的nj树和ml树显示cl群体聚为一支，非长乐群体互相重叠聚为另一支，研究结果显示，长乐群体已经形成了具有明显遗传结构的地理种群。