蒙古狼线粒体基因组序列分析及其系统发育地位

应用long-pcr和克隆测序法得到蒙古狼(canislupuschanco)线粒体基因组全序列，结合genbank中现有犬科动物线粒体基因组数据，应用最大简约法(mp)、最大似然法(ml)和bayesian分析法对蒙古狼的系统发育地位进行了探讨。结果如下：蒙古狼线粒体基因组全长16709bp，包含13个蛋白质编码基因、22个trna基因、2个rrna基因和1个非编码区。序列碱基的组成存在明显的a-t偏好性。trna基因中除trna-ser(agy)缺少双氢尿嘧啶(dhu)臂以外，其余均能折叠成典型的三叶草二级结构。大多数蛋白质编码基因的起始和终止密码子与犬科动物有报道相同，coxⅱ基因的起始密码子为ata，与其他犬科动物不同。基于12srrna+16srrna+h链上的12个蛋白质编码基因的联合数据的系统发育分析发现，在已报道的狼亚种数据中，西藏狼(canislupuslaniger)的分化时间最早，其次为阿拉伯狼(canislupusarabs)，蒙古狼与欧亚狼(canislupuslupus)的系统发育地位最为接近。