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生态学报 2008
金沙江干热河谷区胡枝子(lespedezamichx)根瘤菌多样性及其系统发育Keywords: 数值分类,boxair-pcr,16s,rdna,pcr-rflp,gsⅱ基因,序列分析 Abstract: 研究利用数值分类、boxair-pcr指纹图谱、16srdnapcr-rflp、16srdna和gsⅱ序列分析等方法,研究了分离自金沙江干热河谷区的86株胡枝子根瘤菌的多样性和系统发育,结果表明金沙江干热河谷区胡枝子根瘤菌蕴涵丰富的生物多样性。通过数值分类,供试未知菌株表现出极大的表型性状多样性,能耐高温(60℃)和低ph(4.0),在低温(10℃)或者高ph(9.0)条件下生长很差,耐盐性也很差。供试未知菌株的16srdna用haeⅲ、mspⅰ、hinfⅰ和taqⅰ酶切后具有16种遗传图谱类型,其中10株供试未知菌的16srdna遗传图谱类型不同于所选用的已知参比菌株。boxair-pcr的分群结果分散,很多在16srdnapcr-rflp中具有相同遗传类型的菌株也表现较大差异,表明了供试菌株在基因组水平上差异很大。序列分析结果表明,6株代表菌株分布于rhizobium、sinorhizobium、mesorhizobium、bradyrhizobium4个属,16srdna序列与gsⅱ序列分别构建的系统发育树在属水平上基本一致,但16srdna序列的同源性比gsⅱ高,6株代表菌株间16srdna序列的同源性在87.5%~99.5%之间,gsⅱ序列的同源性在79.4%~89.8%之间;而代表菌株与亲缘关系最近的参比菌株间的16srdna序列的同源性为99.9%~100%,gsⅱ的同源性为88.9%~99.6%。
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