基于转录组平台的蛤仔微卫星标记筛选

以菲律宾蛤仔转录组测序所得拼接序列为基础,采用misa软件进行微卫星分析,对其中的145个微卫星位点进行引物设计,得到具有清晰扩增条带的微卫星位点58个。对大连庄河野生蛤仔群体的扩增结果表明,18个位点显示单态性,40个位点表现为多态性。该群体40个多态性微卫星位点得到的等位基因数在2-6之间,平均等位基因数为3.4250±0.9718,观测杂合度和期望杂合度分别在0.0000-1.0000和0.0615-0.7996之间,平均值分别为0.2727±0.2272和0.4739±0.1902,群体平均nei指数为0.4664±0.1872。多态信息含量(pic)在0.0586-0.7529之间,平均值为0.4148±0.1707,其中16个微卫星位点的pic值大于0.5,为高度多态性,15个位点0.25