南海西沙海槽表层沉积物微生物多样性

利用非培养的分子技术研究了西沙海槽表层沉积物中的微生物群落。沉积物中扩增的古菌16s？rdna？序列分属两个大类：泉古生菌(crenarchaeota)和广古生菌(euryarchaeota)。以marine？crenarchaeotic？groupⅰ？(古菌16s？rdna文库的49.2%)和terrestrial？miscellaneous？euryarchaeotal？group？(16.9%)为主要类群；其余为marine？benthic？group？b？(9.7%)、？marine？benthic？group？a？(4%)、？marine？benthic？group？d？(1.6%)、novel？euryarchaeotic？group？(0.8%)和？c3(0.8%)。细菌克隆子多样性明显高于古菌，16s？rdna序列分别来自变形杆菌(proteobacteria)(细菌16s？rdna文库的30.5%)、浮霉菌(planctomycetes)(203%)、放线菌(actinobacteria)(14.4%)、厚壁菌(firmicutes)(15.3%)、屈桡杆菌(chloroflexi)(8.5%)、酸杆菌(acidobacteria)(34%)、candidate？division？op8？(2.5%)、拟杆菌/绿菌(bacterioidetes/chlorobi)(1.7%)和疣微菌(verrucomicrobia)(17%)。变形杆菌为优势类群(包括alpha-和delta-proteobacteria亚群)。多数克隆子为未培养细菌和古菌。结果表明南海表层沉积物中蕴含大量未知的微生物资源。