亚历山大藻属微卫星标记的筛选

采用生物信息学方法，从塔玛亚历山大藻的ests数据库中筛选微卫星（simplesequencerepeat,ssr）位点，设计ssr引物，利用毛细管电泳对4株塔玛亚历山大藻（alexandriumtamarense）、2株相关亚历山大藻（alexandriumaffine）和1株链状亚历山大藻（alexandriumcatenella）进行种内、种间遗传多样性分析，获得以下主要结果：（1）从6830条非冗余的ests中共查找到222个ssr，平均每18.5kb就有一个ssr，三核苷酸重复在所有的重复类型中所占比例最大，达到48.2%，重复单元ctg/cag出现频率最高。进一步筛选出12条ssr引物，用于遗传多样性分析。（2）种内遗传多样性水平整体偏低，多态性引物比率仅为4167%，nei’s基因多样性平均为0.2130。种间遗传多样性水平较高，多态性引物比率为75%，nei’s基因多样性平均水平为04643；另外，种间遗传分化系数较高，平均水平为0.7051。（3）对7个样品的聚类图分析发现，a.tamarenseccmp116与a.affineccmp112遗传距离极为接近；a.tamarenseathk9301、ccmp1598和atdh01相互聚在一起；a.catenellaacdh01与a.tamarense分属两枝。以上结果表明，ssr标记在亚历山大藻种内遗传多样性分析方面是一种非常有用的工具。