基于nad5的西施舌漳州群体遗传分化水平分析——以蛤蜊属2个物种差异水平为参照

扩增了西施舌日照、连云港、北海、漳州4个野生群体、四角蛤蜊和中国蛤蜊各1个群体共73个样本的nad5基因片段,测序获得了480bp核苷酸序列,分析核苷酸的多态性,旨在评估福建漳州西施舌与日照、连云港、北海西施舌之间的分化水平。结果:从73个序列中共检测到44种单倍型(hap),其中西施舌4个群体有29种haps,四角蛤蜊和中国蛤蜊分别有10种和5种haps,漳州群体与北海、日照、连云港群体单倍型有明显差异;将西施舌分为北海、日照、连云港组(gp1)和漳州组(gp2)2个组,分析核苷酸差异,gp1与gp2间的t、a、g含量差异极显著(p<0.01)。gp1与gp2间的遗传距离与组内(gp1、gp2)遗传距离之比为25.1-41.8,四角蛤蜊与中国蛤蜊之间的遗传距离与种内个体间遗传距离之比为24.4-36.7,gp1、gp2间的差异达到了四角蛤蜊和中国蛤蜊种间差异水平,而日照、北海群体间的遗传距离只有0.009,北海与日照群体地理位置虽远,但遗传差异则很小;amova分析显示漳州西施舌发生了极显著遗传分化(fst=0.966-0.978,p<0.01)。