麻竹est-ssr标记开发及其对慈竹变异类型的分析研究

利用麻竹(dendrocalamuslatiflorus)已有的est序列,开发了一批est-ssr分子标记,并用于慈竹(bambusaemeiensis)栽培变异类型的多态性研究。结果表明,在麻竹9574个est中找到了331个est,含有381个ssr位点,ssr出现的频率为3.98%。est-ssr的重复类型共有59个,其中2个核苷酸的重复最多,占63.8%,其次是3个核苷酸的重复序列。根据含有ssr的est序列设计出了44对引物,对慈竹及其变异类型进行了扩增效率、多态性及通用性检测,其中37对引物能够扩增出稳定且清晰的条带,且扩增具有多态性,扩增片段长度主要集中在100~1000bp,引物有效率达84.1%。遗传相似性分析结果显示,所检测样品间遗传距离为0.263~0.840,平均为0.552,其中‘黑笋慈竹’与‘琴丝慈竹’、‘蛇头慈竹’与‘龙头慈竹’之间的遗传距离较近,而‘罗汉慈竹’与其他样品的遗传距离最远。