巨桉ago基因家族的生物信息学分析

为了解巨桉(eucalyptusgrandis)中argonaute(ago)的功能,经全基因组序列分析,巨桉中存在14个ago基因家族成员,基因长度为2676~3225bp,编码的蛋白质具有保守的piwi、paz、duf1785结构域。巨桉egragos基因可分为3组,内含子和外显子结构具有明显的组织特异性。组内成员核苷酸序列和氨基酸序列保守性较高,同源性分别达到88.14%和82.97%。egrago基因分布于第2、4、7、8、10、11条染色体上,在进化过程中存在着串联复制和大片段基因复制机制。预测巨桉的大部分ago蛋白定位于细胞核和胞质中,表现出偏碱性和亲水性,具有较高的脂溶指数。基因表达分析表明,桉树egrago成员在不同组织中的表达有明显差异,与木材形成相关的组织/器官中有较高的表达。这些为深入研究egrago基因的功能奠定了基础。