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ISSN: 2333-9721
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一步法rt—pcr克隆水稻线粒体磷转运蛋白基因及其序列特征分析

DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2005.4.005, PP. 303-309

Keywords: 水稻,线粒体磷转运蛋白,序列分析,基因组结构,rt—pcr

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Abstract:

以水稻广亲和品种cpslo17幼穗为材料,用一步法rt—pcr(逆转录聚合酶链式反应)克隆了一个长度为1118bp的编码线粒体磷转运蛋白的osmpt基因。序列分析表明其包含了基因完整的编码序列,编码由368个氨基酸组成的线粒体磷转运蛋白,它与玉米、大豆、lotusjaponicus、betulapendula、拟南芥的线粒体磷转运蛋白氨基酸序列相似率分别为93.5%,85.6%,83.8%,83.7%,81.1%。氨基酸疏水谱分析显示它有线粒体磷转运蛋白家族高度保守的6个跨膜结构域。水稻线粒体磷转运蛋白n端富含精氨酸(arginine)、丙氨酸(alanine)和丝氨酸(serine)。ipsort预测其蛋白n端具有定位于线粒体的信号肽序列,进一步分析表明此编码区段有6个外显子和5个内含子。rt—pcr结果表明,osmpt基因在水稻两个亚种粳稻和籼稻的叶片中均有表达,在cpslo17营养器官和生殖器官中都有高水平表达。水稻线粒体磷转运蛋白的克隆和表达分析将为研究其结构和生物学功能奠定基础。

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