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ISSN: 2333-9721
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小果野蕉(musaacuminata)全基因组nbs抗病基因的鉴定与分析

DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2014.05.010, PP. 486-494

Keywords: 小果野蕉,生物信息学,基因组,nbs抗病基因

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Abstract:

为探讨小果野蕉(musaacuminata)中nbs基因的功能,基于新近发表的小果野蕉全基因组序列,对nbs基因家族进行鉴定、分类和染色体定位,解析基因的复制特征、系统发育关系及上游启动子调控元件类别,推测这些基因在小果野蕉中可能的功能。结果表明,在小果野蕉全基因组中鉴定出125个nbs基因,包括78个标准和47个非标准nbs基因。多数nbs基因在染色体上以基因簇形式存在,串联复制是nbs基因家族扩张的主要动力。系统发育分析表明标准nbs基因形成两大分支,77个标准nbs基因有est表达支持。这为群体水平的抗病基因型筛选提供了本底信息,促进栽培香蕉分子抗病育种进程。

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