基于rbcl和matk序列探讨马鞭草科部分植物的系统学位置

为探究适用于马鞭草科植物的dna条形码及该类群的系统分类关系,对豆腐柴(premnamicrophylla)的叶绿体基因ycf6-psbm、trnv-atpe、rbcl、trnl-f、psbm-trnd、atpb-rbcl、trnc-ycf6、trnh-psba、rpl36-infa-rps8和核基因its序列进行了pcr扩增和测序,结果表明,仅rbcl、trnl-f、trnh-psba序列的pcr扩增以及测序效果较好,而its不能得到明显的扩增条带,ycf6-psbm不能成功测序,其它序列存在有部分双峰或噪值高等问题。根据dna条形码标准,rbcl序列是所有测试条码中相对最适合的。应用rbcl和matk序列对马鞭草科(verbenaceae)豆腐柴属、牡荆属(vitexl.)、马鞭草属(verbenal.)和大青属(clerodendruml.)等4属与唇形科宝盖草属(lamiuml.)、水苏属(stachysl.)、鼠尾草属(salvial.)和香科科属(teucriuml.)等4属的分类和系统发育关系进行分析,以紫草科lithospermummultifloruml.为外类群,最大简约法对2个片段的单独和联合矩阵分别构建系统发育树。豆腐柴属和大青属应从马鞭草科划入唇形科,马鞭草属仍归于马鞭草科,而牡荆属的系统学位置还需更多的证据。