基于dgge分析的大鼠粪便及肠道细菌总dna提取方法研究

？为获得高质量肠道细菌总dna用于研究膳食纤维对大鼠肠道菌群的影响，本实验以sd大鼠为实验动物，灌胃番茄皮膳食纤维，收集大鼠粪便及盲肠，－70℃冰箱保存。分别采用tiangen细菌基因组试剂盒法、蛋白酶k-十六烷基三甲基溴化铵(ctab)法和溶菌酶法提取粪便和肠道中的细菌总dna，通过琼脂糖凝胶电泳、细菌通用引物pcr扩增和变性梯度凝胶电泳(dgge)对提取效果进行观察比较，发现将溶菌酶法进行改进后，可以获得满意效果。改进后的溶菌酶法与另外两种方法比较，具有成本低、时间短、dna得率高和多样性好等特点；该方法获得的dna样品适合于用dgge技术分析大鼠粪便及肠道菌群。