副干酪乳杆菌乳酸脱氢酶的生物信息学分析

？目的：分析和预测副干酪乳杆菌(lactobacillusparacasei)乳酸脱氢酶(lactatedehydrogenase，ldh)基因及其编码蛋白的结构和特性，以指导其生物学功能的实验研究。方法：利用美国国家生物技术信息中心(ncbi)和瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统(expasy)中有关基因和蛋白的序列和结构信息分析的各种工具，结合其他生物信息学分析软件，如clustalx、vmd，从数据库中得到乳酸脱氢酶基因，分析、预测该基因编码的蛋白理化性质、翻译后的修饰位点、拓扑结构、二级结构、三级结构和功能域。并与其他微生物的乳酸脱氢酶蛋白序列进行比对，得出它们的保守序列。结果：该基因编码335个氨基酸，其蛋白理论分子质量为36608.8u，预测该蛋白有3个跨膜区。与干酪乳杆菌的乳酸脱氢酶进化关系最近。结论：应用生物信息方法可预测得到副干酪乳杆菌的乳酸脱氢酶的结构与功能方面的信息。