草兔线粒体基因组全序列及其系统发育关系分析

？草兔(lepuscapensis)在我国数量多,分布广,但人们对草兔的系统地理学、草兔与其他兔类的系统发育关系了解不多,其亚种水平的分类也长期存在争议。本研究通过la-pcr技术对草兔线粒体基因组全序列进行pcr扩增、序列测定和分析,并基于线粒体基因组12个蛋白质编码基因10776bp的核苷酸序列,采用贝叶斯法(bi)和最大似然法(ml)构建哺乳纲(mammalia)灵长总目(euarchontoglires)5个目12种动物的系统发育关系,结果支持兔形目(lagomorpha)的单系起源,其中草兔与欧洲野兔(l.europaeus)亲缘关系最近,两者互为姐妹群,进而与家兔(oryctolaguscuniculus)构成姐妹群关系。此外,基于线粒体细胞色素b基因全序列,构建31个兔类个体的系统发育关系,结果显示,草兔与雪兔(l.timidus),云南兔(l.comus)与高原兔(l.oiostolus),东北兔(l.mandschuricus)与塔里木兔(l.yarkandensis)有较近的亲缘关系,而在草兔内部,中国的草兔与南非草兔亲缘关系较远,采自江苏盐城的草兔与来自山东、陕西、四川的草兔聚为一支,具有明显较近的亲缘关系。该研究为更好地探讨草兔系统发育关系提供了进一步的分子生物学资料.