狐源犬瘟热病毒h基因和f基因的克隆与序列分析

？根据genbank发表的犬瘟热病毒(cdv)核酸序列[cdv5804(ay386315)、cdv01-2689(ay649446)、cdva75-17(af164967)、cdv00-2601(ay443350)、cdv98-2645(ay445077)、cdv98-2654(ay466011)和cdvonderstepoort(af378705)],分别设计合成扩增cdvh基因和f基因的引物。采用rt-pcr技术扩增狐源cdv泰安株(cdv-fox-ta)h基因和f基因,分别将h基因与f基因克隆进pmd18-t载体,进行序列分析。结果表明,cdv-fox-ta株h基因有1个orf,全长1824bp,编码607个氨基酸,与cdvonderstpoort、cdvconvac的同源性分别为89.2%和90.6%,与cdva75-17的同源性为98.6%,与cdvlp的同源性为98.7%。cdv-fox-taf基因有1个orf,全长1889bp,编码662个氨基酸,cdvf蛋白信号肽区域易发生突变,但f0蛋白裂解点(rrqrr)、13个半胱氨酸残基、4个潜在的天冬氨酰糖基化位点和2个疏水区都高度保守。cdvh基因和f基因系统发生分析表明,cdv-fox-ta与cdva75-17和cdvlp亲源关系较为密切。