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ISSN: 2333-9721
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兽类学报  2009 

dna池结合dhplc和直接测序技术在江豚snps检测中的应用

Keywords: 江豚,snps,dhplc,dna池

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Abstract:

?选取江豚基因组中的2个已知单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,snps)位点,通过pcr扩增,将pcr产物按基因频率不同制备成0~50%的11个dna池(dnapool),用于变性高效液相色谱(denaturinghighperformanceliquidchromatography,dhplc)和直接测序分析,以探讨dna池中基因频率的最低要求。结果显示,当稀有等位基因的基因频率不少于5%时可在dhplc检测过程中明显分辨;而利用dna池进行直接测序时的基因频率则需达到10%。这提示,为保证dhplc分析的准确性和可靠性,制备dna池时等摩尔dna混合的个体数最好不超过10个。dna池结合dhplc技术的高效性与准确性可在大规模的snps位点筛选中发挥作用。

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