北极狐ghr基因cdna的克隆及序列分析

？本文根据狗(af133835)的ghr基因cdna编码全序列设计了三对引物,利用rt-pcr方法克隆出北极狐ghr基因编码区全长cdna序列(genbankaccessionno.eu304325)。结果表明,北极狐ghr的orf为1917bp,编码638个氨基酸的前体蛋白,由18个氨基酸的信号肽和620个氨基酸的成熟肽组成。通过同源性比较发现北极狐与狗的同源性最高,达到98%。另外,利用邻接法(nj法)构建的分子系统进化树聚类结果表明,北极狐与狗先聚为一类,该聚类结果与传统的物种进化关系基本一致。另外,通过氨基酸对位序列比较发现,北极狐ghr在氨基酸序列上存在明显的特异性,如45和451位分别为a和e,而其它物种均分别为t(大鼠为k)和a(牛羊为v,鼠为t)。