三七甲羟戊酸激酶pnmvk1基因的克隆和生物信息学分析

药用植物三七通过甲羟戊酸途径(mevalonicacidpathway)合成三萜皂苷生物合成的前体。甲羟戊酸激酶(mevalonatekinase,mvk)则是甲羟戊酸合成途径中atp依赖的限速酶之一。本研究根据课题组已获得的三七[panaxnotoginseng(burk.)f.h.chen]转录组数据中的mvk1转录本序列,利用rt-pcr方法获得三七mvk1(pnmvk1)基因的全长cdna序列;对pnmvk1蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析,并预测了该蛋白的结构与功能;利用实时荧光定量pcr方法检测了pnmvk1基因在三七的根、茎、叶、花中的表达情况。序列分析表明,克隆获得的三七pnmvk1基因长为1164bp,编码387个氨基酸,genbank登录号jq957844。生物信息学预测pnmvk1蛋白不含跨膜区,不含信号肽,具有ghmp激酶等保守结构域。pnmvk1基因在三七的根中表达丰度最高。本研究成功克隆并分析了三七mvk1的全长序列,为进一步阐明三七三萜代谢途径奠定基础。