西洋参pqerf1基因的克隆和生物信息学分析

乙烯响应因子(ethyleneresponsefactor,erf)是具有petala2(ap2)结构域的转录因子。本研究通过西洋参(panaxquinquefoliusl)的转录组高通量测序结果分析获得75条具有ap2结构域的转录因子序列,并克隆到一条开放阅读框为933对碱基的基因序列,定名为pqerf1。基因表达分析结果表明pqerf1基因受茉莉酸甲酯(meja)的诱导,这与人参皂苷含量的受诱导模式相同。蛋白结构预测结果表明pqerf1是定位于细胞核的具有完整保守的ap2结构域的转录因子,interproscan蛋白功能结构域分析结果表明pqerf1很可能为发病机制相关蛋白;序列比对和进化关系分析结果也显示pqerf1与发病机制相关蛋白(烟草nterf4)、次生代谢产物相关合成蛋白(野胡萝卜dcerf1)和花衰老相关蛋白(矮牵牛pherf12)的相似性高,且系统进化关系较近。因此,推测pqerf1基因可能是参与西洋参次生代谢产物合成调节、抗病性和衰老相关的重要基因。