基于454flx高通量技术的厚朴叶绿体全基因组测序及应用研究

？叶绿体基因组序列在中药dna条形码鉴定及基因工程生物制药方面具有广泛的应用前景。本文应用454高通量测序技术对厚朴进行了叶绿体全基因组测序,建立了标准测序流程。生物信息学分析共获得有效序列重叠群(contig)14个,测序覆盖度达到99.99%。厚朴叶绿体基因组大小为160183bp,大(lsc)、小(ssc)单拷贝区大小分别为88210bp和18843bp,反向互补重复区(ir)大小为26565bp,共注释叶绿体基因126个,其中每个ir区17个。厚朴与木兰亚纲其他物种的叶绿体编码基因在种类、排列顺序及结构大小上基本一致。采用叶绿体81个蛋白编码基因对厚朴及同属5个种9个样本进行了分子鉴定,鉴定效率100%,并且可以成功区分不同产地的凹叶厚朴。以上结果表明,本研究建立的标准测序流程适用于叶绿体基因组测序,叶绿体基因组序列可有效区分厚朴及近缘物种。