金银花类药用植物fatb基因克隆和生物信息学分析

从忍冬(lonicerajaponicathunb.)转录组测序结果中分析获得1个fatb基因。分别以忍冬、红白忍冬(lonicerajaponicathunb.var.chinensis(wats.)bak.)、红腺忍冬(lonicerahypoglaucamiq.)和水忍冬(loniceradasystylarehd.)新鲜花蕾为材料,利用rt-pcr技术克隆获得了ljfatb、lhfatb、ljcfatb、ldfatb基因的全长cdna,并进行生物信息学分析。结果表明ljfatb、ljcfatb、lhfatb和ldfatb与拟南芥atfatb具有较近的亲缘关系。ljfatb、ljcfatb、lhfatb和ldfatb的核苷酸序列、蛋白特性及其二级结构有所差异,但其蛋白均具有保守的fatb底物结合位点和催化活性位点,且在花蕾中的转录水平没有显著差异。因此推测ljfatb、ljcfatb、lhfatb和ldfatb可能具有与atfatb相同的生物学功能。